药学实验教学中心成立于2003年，在原江西医学院化学实验室的基础上逐步建立起本科生药物化学实验室、天然药物化学实验室、药剂学实验室、生物药剂学与药物动力学实验室、生药学实验室、药用植物学实验室、临床药理实验室、药物分析实验室、仪器分析实验室以及药学虚拟仿真实验中心。

药学实验教学中心位于南昌大学医学部第五实验大楼内，建筑面积1919平方米，设置有实验室、天平室、仪器室、准备室等。中心开设了15门、约100个项目的基础实验和专业实验课程。授课对象主要为药学专业和临床药学专业本科生。

中心有一支结构合理、专业扎实的实验教学师资队伍。其中，实验教师47人，实验技术人员6人，高级职称33人，博士学位30人，有硕士及以上学位49人。

中心自成立以来，以人才培养为中心，以锻炼实验技能、培养科研思维为宗旨，建立了基础验证、综合设计、创新研究多层次的实验教学体系。

中心现有仪器设备约1200台（套），设备总价值近2000万元。包括液质联用仪、红外分光光度计、高压液相色谱仪、气相色谱仪、荧光分光光度计、紫外分光光度计、压片机、制粒机等大中型仪器。这些仪器和实验室在保证实验教学基础上全天候开放，为学生创新性研究提供必要的实验场地和仪器设备支持。

药学实验教学中心针对学科特点，制定了一系列规章制度，使中心的实验教学和管理工作趋于规范化、科学化和制度化。实行实验技术人员、实验室和仪器设备的统一管理，提高人员、实验室和设备的共享和使用效率。